有时香菇产量很低甚至绝收，严重影响经济收入，对种植者打击很大。栽培蘑菇产量低，无收获有几个原因。
1.蘑菇繁殖地选择不当如种植在阴暗、通风不良或不卫生的地方，导致杂菌污染严重，蘑菇生长失败；有的虽然不愿意出菇，但是出菇期因为空气流通不畅，二氧化碳含量高而中毒，长不出菇，或者形成畸形菇。所以种蘑菇首先要选择通风条件好，光线散射的地方，并保持干净卫生，做好消毒措施。第一次出菇的地方要用石灰水刷墙，在地上撒生石灰进行消毒，第二天把撒在地上的生石灰清理干净；老蘑菇场可以用高锰酸钾和福尔马林熏蒸消毒；在有害虫的蘑菇场喷洒杀虫剂杀死害虫，然后进行消毒。
2.是培养料选择或准备不当。用污染结块的原料种植蘑菇，容易造成大面积污染或无菌。配制培养基时，培养基中加入过量的尿素等氮肥，接种后氮肥易分解释放氨气，使菌丝中毒，细菌不能正常生长。所以好的选材一定和食材有关。清洗原料，做好消毒工作。配料时不可随意添加化肥。蘑菇堆积发酵时，才能加入尿素补充氮源。同时，在配料过程中，要特别注意培养基的湿度，含水量不能过高或过低，否则不利于细菌的生长。
3.菌种选择不当，如冬季选择高温品种，春季选择低温品种，或播种老化或污染的菌种，容易导致发菌慢或不发菌，迟发或不发菌。因此，种植香菇时应根据当时当地的气候条件选择合适的菌种，不能使用老化或污染的菌种。
4.香菇管理不善在自然温度条件下，出菇期的管理是光、水、通风。出菇期散射光能满足需要，菇房出菇光照不足，出菇慢，可辅以电灯诱导出菇。空气湿度是结果期的重要条件。为增加湿度，盲目增加喷水量，甚至直接在菇体上喷水，会使一些小菇窒息，一些长成的菇会因水害而腐烂变黑。所以香菇出菇期间要注意补水的方法，喷到空中。同时也要注意通风，以免二氧化碳过多堆积，导致形成子实体或畸形菇。此外，不合理的收割也影响产量的提高。有些农民收获大蘑菇，保留小蘑菇，让小蘑菇继续生长。这样一来，它们不仅长不起来，还会延长出菇期，影响下一个蘑菇的产量。
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