接种后，正常生长的菌丝呈白色致密粗大，呈扇形向前发展，菌丝分解的棉壳物质变为黄褐色。如有一段菌丝断裂、断开，则称为“断菌”。这种情况是由于堆肥含水量过高，培养时温度过高造成的。选择合适的湿度和温度，可以防止“破菌”现象的发生。堆肥上长出的菌丝体发生退化、萎缩的现象称为“芽孢杆菌”。如果堆肥太干、太松散，长出来的菌丝就会很弱很弱。栽培时如果温度过高，通风不良，或有虫害，都会引起“芽孢”现象。改善以上条件，可防止“杆菌”的发生。
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