新冠病毒潜在中间宿主可能是乌龟!


三年来,新冠病毒已感染我国数万人,造成数千人死亡,并蔓延至全球20多个国家。病毒之所以能够传播,是因为它有宿主。那么新型冠状病毒的宿主有哪些动物呢?

疫情初期,研究人员陆续提出蝙蝠可能是新冠病毒的天然宿主,蛇、穿山甲可能是潜在的中间宿主。

2月26日,湖北医科大学附属人民医院刘龙和广州暨南大学吴建国课题组在《医学病毒学杂志》上发表论文称,甲鱼(西锦龟、绿甲鱼、中华软甲龟)甲鱼)也可能是新冠病毒向人类传播的潜在中间宿主。

最新研究利用冠状病毒刺突蛋白和宿主ACE2受体的组成和差异来预测SARS-CoV-2的潜在中间宿主。

该研究的重点是比较SARS CoV-2 和SARS-CoV、蝙蝠SARS 样CoV 和其他冠状病毒之间的刺突序列。这有利于进化分析和搜索可能的病毒库。此外,ACE2 结构和结合基序比对分析有助于提供区分潜在宿主的线索。

SARS-CoV-2 编码至少27 种蛋白质,包括15 种非结构蛋白、4 种结构蛋白和8 种辅助蛋白。刺突蛋白(S) 是一种位于病毒颗粒外壳上的结构蛋白,负责与宿主受体血管紧张素转换酶2 (ACE2) 结合。研究刺突蛋白中受体结合域(RBD)序列的进化关系有助于了解病毒起源的趋势。

研究结果表明,蝙蝠SARS样冠状病毒RaTG13与SARS-CoV-2的整体基因组具有96.2%的序列同一性。值得注意的是,SARS-CoV 是穿山甲标本中分布最广泛的冠状病毒。

刺突RBD-受体相互作用是决定冠状病毒宿主范围的关键因素。研究小组比较了SARS-CoV、蝙蝠或穿山甲SARS 样冠状病毒和SARS-CoV-2 的刺突蛋白的RBD 序列。

蝙蝠SARS样冠状病毒中位于外部子域的残基473至490的删除似乎证实了这些病毒不会自然感染人类。目前没有直接证据表明蝙蝠SARS样冠状病毒曾经感染过人类。

穿山甲SARS 样冠状病毒SRR10168377 与蝙蝠SARS 样冠状病毒RaTG13 仅有85% 的同一性。这表明,如果仅聚焦刺突RBD,穿山甲SARS 样冠状病毒SRR10168377 有可能穿过宿主屏障感染人类。

与SARS-CoV 与人类ACE2 的结合类似,当与SARS CoV-2 刺突蛋白相互作用时,受体上的残基31、41、82、353、355 和357 定位于表面。

从ACE2受体位置41和353的RBD结构域中的Asn501来看,海龟和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人类。这表明海龟和穿山甲可能是SARS-CoV-2 的潜在延伸宿主。

了解结构结合机制将有助于找到确切的病毒库并有助于制定预防对策。通过冷冻电子显微镜对SARS-CoV-2 Spike 蛋白晶体进行紧急分析将有助于验证SARS-CoV-2 Spike RBD 与人类ACE2 或其他宿主受体之间相互作用的结合点。

据报道,SARS-CoV-2刺突蛋白与ACE2的结合能力比SARS-CoV强得多。这表明SARS-CoV-2存在更多的中间宿主。

龟类目前被称为病毒库,携带数十种病毒,包括彩虹蛙病毒(RV)、尼多病毒(NV)、乳头瘤病毒(PV)、鳖虹彩病毒(STIV)、鳖系统性败血症球体病毒(STSSSV)、龟小核糖核酸病毒(ToPV)和中华鳖出血综合征病毒(TSHSV)。不能排除蝙蝠SARS样冠状病毒RaTG13或其他SARS样冠状病毒感染海龟并进化传播给人类。

从SARS-CoV、MERS-CoV到SARS-CoV-2,蝙蝠是冠状病毒的天然宿主,但中间宿主不同。先前的研究表明,由于与其他动物相比,蛇具有相对同义密码子使用(RSCU)偏差,因此很可能是SARS-CoV-2 的野生动物病毒储存库。

果子狸和单峰骆驼作为人畜共患疾病SARS-CoV和MERS-CoV的中间宿主,生活在不同的时间和空间环境中,但它们仍然将冠状病毒传播给人类。这使得短期内很难找到SARS-CoV-2的中间宿主。

对病毒受体结合序列和宿主受体的分析有助于快速瞄准SARS-CoV-2可能的中间宿主。海龟在市场上通常比非法交易的穿山甲更受欢迎。

总之,这项研究提供了一些信息,即与蛇和穿山甲一样,龟类(锦龟、绿海龟、中华鳖)也可能是SARS-CoV-2 向人类传播的潜在中间宿主,但进一步需要进行研究。研究证实。

相关阅读:新型冠状病毒潜在宿主研究

1. 蛇

1月22日,北京大学团队发现新型冠状病毒与蛇存在类似的密码子使用偏好,推断蛇可能是潜在的中间宿主。

2. 蝙蝠

2月3日,中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队在《自然》杂志上发表论文表明,中华菊头蝠极有可能是新冠病毒的自然宿主。

3.穿山甲

2月6日,华南农业大学团队研究表明,穿山甲是新型冠状病毒的潜在中间宿主。

2月20日,香港大学公共卫生学院教授关毅在穿山甲样本中发现冠状病毒,再次表明穿山甲应被视为新冠病毒的可能中间宿主。

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