有些肥料在作物中吸收的阴离子多于阳离子，并在土壤中留下更多的阳离子，从而增加了土壤的碱度。这种被作物吸收养分后增加土壤碱度的肥料称为生理碱性肥料，例如硝酸钠，作物吸收的硝酸盐多于钠离子，钠离子与作物交换的碳酸氢盐结合形成碳酸氢钠，碳酸氢铵水解呈碱性，作物吸收硝酸盐后体内还可以还原生成氨的过程中消耗一定量的酸。农作物为了维持细胞酸碱度的平衡，将体内多余的氢氧化物（OJ-）排出体外，从而提高土壤碱度。所以硝酸钠是一种生理碱性肥料。酸性土壤最好使用生理碱性肥料。
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