花期开始，棉花进入旺盛生长期，需要更多的肥料，更多的氮素吸收和更大的强度。从此，吸氮量占整个生育期吸氮总量的60%，这一时期所需的磷、钾也占总量的一半以上。高产棉花的施肥原则，在基肥的基础上，注意及时追肥管理。近年来，棉花高产栽培管理的发展趋势是，在系统控制的条件下，通过增加棉花种植密度来实现高产。这种创造高产的方法特别适用于新疆棉区。此外，在长江流域和华北产棉区，近年来为保证棉花和粮食作物总产量的持续提高，出现了缩短棉花生育期、大力发展夏播棉的趋势。针对这两个新发展，棉花追肥管理应采取相应的新措施。
过去棉花种植以春季为主，重在追肥和后移(主要指氮肥)，以“三桃”为目标，即要求棉株是以桃倒伏、桃满腰、秋桃打顶为特征的高产株型。因此，在追肥中，提出了施肥重心后移的原则。但现在情况不同了，追肥期要适当往前调。在系统控制缩节胺的条件下，早施蕾花肥对春棉高产有较好的效果，如提早增强根系活力。因此，化控技术的应用为追肥时间的调整提供了保障。棉田起垄前追肥可以减少棉花植株的劳动和机械损伤。尤其是夏播棉或短季棉，更要强调蕾期提前追肥，保证棉苗提早出苗，减少晚熟威胁。总之，在采取系统控制的前提下，棉花施肥全过程以基肥和追肥早施为原则。近年来，高产棉花试验田表明，在缩节胺调控条件下，适时早期追肥有利于根系生长和防止根系早衰。一般情况下，结合锄地追肥，将夏播棉追肥期提前至蕾期(4~5片叶)是可行的。初花期追肥也是可行的(已挂1~2个幼铃)。
蕾期或初花期追肥主要是加适量氮肥(如10~15公斤/亩尿素)。缺钾土壤、速效钾含量低(如砂性强的轻壤土)或基肥不施钾肥和有机肥的棉田，应加氯化钾5~6公斤。此时追施钾肥可以促进棉龄，增加产量。特别是一些种植抗虫棉品种的地块，钾肥用量比普通棉花品种高3倍，能满足高产的需要。
追肥的施用方法应是土肥混合，及时灌溉，不能施尿素，以免挥发损失或熏蒸棉花叶片。生产中经常将尿素撒在地表下雨，既不覆土也不及时灌溉。这种应用方法是不科学的。
此外，对于高产、超高产棉田，如果在吐絮后期生长势头减弱或自动封顶，应及时补施尿素5 ~ 8公斤，防止棉株早衰，争取秋桃。
棉花追肥要因地制宜。根据我国不同产棉区的特点，提出以下追肥应用原则和建议：
黄淮海绵区氮磷肥用量普遍偏高，肥料增产效果下降，但有机肥施用不足，硼、锌等微量元素缺乏时有发生。在高产棉花追肥中，应从现蕾开始掌握追肥的要领
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