冬季，大部分花木会停止生长或生长缓慢，这也是经常疏于管理的时期。事实上，冬季是控制病虫害的关键时期。为了让植物在来年春天长得更好，冬季在病虫害防治上不能掉以轻心。
保证花木生长环境干净。气温低于0时，容易造成花木枝叶枯萎腐烂，滋生细菌。当天气变暖时，这些细菌会损害花草树木。因此，冬天来临后，要定期清理植物的生长环境，将多余的植物连根拔起，带出花园掩埋或焚烧，防止病残者将细菌传染给健康的植物。此外，在清理的同时，管理者也要做好自我消毒，防止病虫害的传播。
冬季清理受病虫害影响的枝叶和修剪是花木管理的重要内容，在气温下降前，工作人员应及时清除受病虫害影响的枝叶，防止病虫害的发生。修剪前，工作人员要充分了解不同苗木的相关修剪知识，掌握病虫害症状，更加全面有效地做好病虫害防治和修剪管理工作。以金桔为例。金桔根部腐烂时，明显可见金桔的枝叶发黄枯萎。此时应剪掉所有枯萎的枝叶，及时更换土壤，保证适当的湿度，有效防止病虫害的发生。
在移植花木之前对土壤进行翻新，主要是及时消除土壤中的病菌和虫卵。如果土壤中害虫过多，必须更换新土，更换前应对土壤进行消毒并补充木炭灰。当然，这种方法主要适用于小规模的花木种植场所。对于大面积的苗圃种植地和面积较大的天然林，土壤翻新后，鸟类和昆虫会吃掉已经翻地的害虫。之后，工作人员会再次清理土壤并翻新，将缺失的害虫和虫卵翻在地上。这些害虫和卵会因为空气供应不足而自然死亡。
冬天来临后，为了防止花木受低温影响，受到病虫害的危害，可以用石灰和水配制成保护液，涂抹在花木的枝干上，可以起到一定的保护作用。同时，在配制保护液时，要注意石灰处理的细节，保护液中不能有结块。涂抹时一定要带好防护工具(如塑料手套)，因为石灰与水接触后会产生高热化学反应，戴上防护工具可以避免烫伤。
在喷洒或浇灌无公害药剂防治花木病虫害时，需要根据不同季节选择合适的无公害药剂进行喷洒或浇灌，不同花木适用的农药也不同。例如，金桔的害虫控制体液与水以1800的比例混合以制备害虫控制液体，而木兰的害虫控制液体与Imphos EC和水以11000的比例混合。
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