菌培期是指从播种开始到出菇前的整个阶段。其作用是保证菌丝在土壤中形成足量健壮的菌丝网络，并将营养袋外源中的养分转移到这个菌丝网络中。以满足后期结果的能量需要。因此，菌种培养是羊肚菌高产的关键前提。近期，北京羊肚菌播种完毕，逐渐进入越冬管理阶段。为保证菌种培养质量，为高产打下坚实基础，现从营养袋补充、温度调节、土壤湿度调节、通风管理、杂菌控制5个主要环节提出以下技术指导意见。请各种植单位参照执行。
1、补充外援营养，保证有效投放
补充外援营养是羊肚菌能否出菇的关键。外源养分袋可以通过菌丝网向土壤中的菌丝网输送养分。播种后7-15天（犁沟表面可见白色“菌霜”）是补充外源养分的最佳时期。一般一亩地（实际栽培面积）放置2000-2600个营养袋，袋间距约20-45cm。每袋干料为500-600g。配料中麦粒不得低于40%，堆肥含水量应控制在55%-60%。营养袋需要彻底消毒。放置时，用钉板或墙纸刀在营养袋的一侧扎或切一个洞，然后将这一侧紧贴土壤压实，以保证菌丝能有效输送营养。
2.低温控制细菌培养，促进营养吸收
羊肚菌是一种中低温食用菌。将发芽温度控制在16以下，可以相对延长培养阶段的能量传递时间，低温控制更容易有效吸收外来养分。低温条件下虽然存在羊肚菌生长速度降低、活力降低等问题，但与储存养分和形成有效菌丝的累积效益相比，低温栽培可以获得更高的产量。冷棚或林下简易设施需注意保温，采用用被子覆盖棚面或犁沟面的方法，避免温度低于0，使菌丝受冻。
3、保持土壤水分，促进菌丝生长
在细菌培养阶段，土壤适宜的相对湿度为35-40%。判断的简单标准是：土的颜色深，土揉成一团，一扔就散了，手上有湿水印，就是合适的含水量。土壤含水量过大或过小，都会对菌丝的生长产生不利影响。例如，土壤含水量过大，透气性差，会影响菌丝的生长；如果土壤含水量太小，菌丝在没有水的情况下很难生长。因此，可以通过加水微喷或微喷的方式调整到合适的含水量。但在养菌阶段要避免大量浇水，以免刺激原基提前形成，造成养分浪费，减产。
4、保持良好的通风，保证充足的氧气
羊肚菌菌丝体的生长需要充足的氧气。因此，垄面覆膜后，可隔3-5天揭一次，通风10-20分钟，适当通风，降低土表湿度。小拱棚薄膜四周无压实或穿孔，通风良好，无需通风。
5、及时清除污染，防止细菌传播
养菌时要注意观察。如发现土壤表面有细菌污染，应及时清除污染区的土壤，然后在污染区撒上少量生石灰粉，以防止细菌传播。若营养袋被细菌污染，应及时将被污染的营养袋挑出，同时在土表撒少量生石灰粉，以消除污染。
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