目前市场上的主要有：克里酚皂、双酚类、有机碘混合物（碘伏）、过氧乙酸、高锰酸钾、硫酸铜和来苏尔等。本文介绍了无公害牛养殖过程中如何进行卫生消毒，供参考。
一、选用正确的消毒方法
喷雾消毒。使用一定浓度的次氯酸盐、有机碘合剂、克里酚皂等，并采用喷雾装置进行喷雾消毒。主要用于牛舍清洁、牛舍环境、牛场道路及周边及进入牛场后的喷雾消毒。辖区车辆进行消毒。
浸泡液消毒。用一定浓度的苯扎氯铵、有机碘混合物或煤酚皂和水溶液清洗双手、工作服或胶靴。
紫外线消毒。人员入口处永久安装紫外线灯，以达到消毒效果。
喷洒消毒。在牛舍周围、入口、产床和牛床下方撒上生石灰或烧碱，以杀死细菌或病毒。
热水消毒。用35-46的温水和70-75的热碱水清洗挤奶机管道，去除管道中残留的矿物质。
二、建立完善的消毒制度
环境消毒
牛舍周围环境（包括运动场周围海域）用2%烧碱或生石灰撒布一次消毒；场地周围及场地内部的污水池、粪坑、下水道口每月用漂白粉消毒一次。
在牛舍大门、入口处设置消毒池，使用2%烧碱或煤酚溶液。
人员消毒
进入生产区域时，工作人员应更衣并进行紫外线消毒。不得穿着工作服离开工厂。外来访客进入场馆时应进行彻底消毒，更换场馆工作服和工作鞋，遵守现场防疫制度。
牛舍消毒
每班牛放入槽后应彻底清洁牛舍，定期用高压水枪冲洗，并喷洒或熏蒸消毒。
用具消毒
定期对饲养用具、食槽和饲料车等进行消毒，可用0.1%盐酸或0.2%-0.5%过氧乙酸消毒；日常用具（如兽医用具、助产用具、饲养用具、挤奶设备和奶罐车等）使用前后应彻底消毒和清洁。
带牛环境消毒
定期对牛环境进行消毒，有利于减少环境中的病原微生物。可用于牛环境消毒的消毒剂有：0.1%氯蛋氨酸、0.3%过氧乙酸、0.1%次氯酸钠等，以减少传染病和蹄病的发生。
牛环境的消毒应避免消毒剂污染牛奶。
牛体消毒
在挤奶、助产、配种、注射治疗以及任何与奶牛接触的操作前，应对奶牛的乳房、乳头、阴道口、后躯等相关部位进行消毒和擦拭，确保奶牛的健康。
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