发病初期，感病植株下部叶片变黄，重病植株因根颈和根系受损，易拔出。对于疾病较轻的植物，不死芽可以长出新芽。发病后期，病部可见菌丝块，病株附近土壤可见深褐色或淡黄色菌核。病原体是Sclerotium delphinii Welch，属于半知菌亚门、丝孢菌亚门、孢子菌亚门和微菌核亚门。 Sclerotium rolfsiiSacc.也可引起类似根颈腐病的症状，但其菌核不如飞燕草大。
发现病株，立即拔除烧毁。
飞燕草宜种植在无病害的土地或经过消毒的土壤中。
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