依据金针菇遗传变异的种性，不断选育优良菌种(株)——从现栽品种

从现有品种中选育出部分高产优质品系是金针菇选育的有效途径之一。 F12-3是成都第一农科所大面积栽培F12（引自陕西铜川食用菌推广站）（谭延辉等，1997）经多年培育获得的优良菌种。筛选。 20即可成型，8-18最适宜。单株重，柄粗（3.9mm），产量高，伞形不易开，菇体淡乳黄色，适宜鲜销和罐头。 花锦11号和花锦14号是华中农业大学应用真菌研究所从国内外引进的29株不同生态型菌株中筛选出的高产优质菌株（马士和，1997）。华金11适宜8-12出菇； Joaquin 14 适合在10-15C 下结果。两株的共同特点是菇柄粗细适中，菇盖小而厚，菇体淡黄色，脆而耐逆性强，生物效率103%110%，适用于新鲜销售和罐头。金针菇传统上在低温季节种植。如果能从现有品种中选出一些耐温性较高的菌种，对于延长鲜菇的供应期或扩大栽培面积具有重要意义。耐高温菌种，如：F-8（昆雁F-908）是商务部昆明食用菌研究所培育的耐高温菌种； 15-26时可正常出菇。在栽培方面，具有发芽快、结果早、产量高、抗逆性强等特点。子实体大小整齐均匀，每丛120余株，色泽金黄，质地脆嫩，纤维少，菇质好。