蘑菇种植后清理出来的堆肥是下脚料,因为堆肥经过平菇菌丝体的相关酶分解转化后,其营养结构发生了很大的变化,平菇菌丝体的残渣,粗品的含量纤维和木质素分别降低50%和30%以上,粗蛋白提高1倍以上。因此,除将发霉变质的下脚料用作肥料外,对一般下脚料应进行综合利用,提高其经济价值。用作肥料:剩菜结构疏松,有机质含量高。施肥是最常用的方法,可以改善土壤团粒结构,提高地力。作饲料:下脚料晒干粉碎后制成菌糠,也可直接打成基础饲料(饼、酒糟、麸皮、青饲料等)喂养畜禽。用量:鸡基础饲料的5%20%,猪基础饲料的20%40%,牛基础饲料的30%50%。用于食用菌的繁殖:在生产中进行发酵和无菌处理,然后用于草菇、平菇等食用菌的栽培,配方中加入一定量的辅料和新培养料.用作可再生能源:以下边角料加猪粪(重量比1:1.4)作为发酵原料生产沼气,不仅可以缩短沼气的发酵周期,还可以提高沼气的产量。