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在所有危害香菇生长的杂菌中，木霉菌的威胁最大。木霉菌又称绿霉菌，广泛分布于各种植物残体、土壤和空气中。木霉菌至今尚无理想的根治药物。因此，营造适宜香菇菌丝生长而不利于木霉菌繁殖的生态环境是控制危害的根本措施。一旦发生木霉菌危害，要立即通风除湿，以抑制木霉菌的扩展。真菌期培养物感染后，可采用注入药液的方法抑制木霉菌的增殖。常用药液有5%石炭酸、2%甲醛、1:200倍50%多菌灵、75%甲基托布津和pH值为10的石灰水。此外，在污染处撒上石灰粉，控制效果也很好。
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