在食用菌生产中，由于各种原因，菌种遗传物质常发生变异，致使优良性状减少或消失，产量下降，品质下降。这是菌株的降解。 （一）品系退化： 1、品系退化的本质：品系退化的本质是遗传物质的可遗传变异。细菌种群退化是一个从量变到质变的渐变过程，当种群中发生有害突变的个体数量显着增加，从而占据优势时就会出现。对于一个群体来说，个体细胞的退化变异会随着细胞的分裂而逐渐增加，从而逐渐增加衰退个体的数量，最终导致整个群体发生严重衰退。虽然细菌种群的退化很常见，但可以采取适当的措施来延缓退化过程，将退化种群控制在最低限度。虽然个体差异可能是瞬时过程，但应变退化需要更长的时间。因此，在退化的品系中，往往有少量个体没有退化，这是品系复壮的基础。
2、菌株变性的原因及表现： 菌株变性的主要原因有交叉感染、自杂交、基因突变、培养条件不适宜等，病毒感染也可引起菌株变性。食用菌菌种感染病毒后，病毒的数量不仅会随着菌丝体的扩大繁殖而增加，还会通过携带病毒的孢子传给下一代。当菌株携带一定浓度的病毒颗粒时，在培养过程中会出现产量下降、品质下降等降解现象。除了与其自身的遗传特性和菌株退化的环境密切相关外，还受到转管次数、机械创伤等外界因素的影响。菌种退化的主要表现是理想的优良性状逐渐丧失，继而菌丝体生长弱，代谢能力下降，产量下降，易受病虫害侵染。
3、防止菌株衰退的措施：从某种意义上说，菌株退化是一种不可避免的现象，但仍然可以采取各种措施来防止菌株过早衰退。 (1) 控制母种转移次数：理论上可以多次转移菌株；但由于操作过程中机械损伤对菌丝体的影响，菌种会发生变异，而大多数变异对菌种是有害的。是不利的。因此，如果可能，尽量减少管转移的次数。实践证明，将生产用菌种的转移控制在5代以内较为适宜。 （2）防止菌种混杂在菌种转移和结果管理过程中，加强品种的隔离管理，减少品种间混种的机会，防止不同品种孢子的传播，保证品种的遗传特性。好的品种比较稳定。 (3)经常更换培养基配方：经常更换培养基配方，可以增强菌株对不同培养基质的适应性，有利于防止菌株降解。 4、采用合适的方法保存菌种：保存菌种时应采用短期、中期和长期保存方法相结合，根据不同需要选择不同的保存方法，以减少转移次数保存菌种的保存，尽量避免保存衰退过程中出现菌种。 (5)尽量为菌种的产生创造良好的条件：创造适宜的营养和环境条件，促进菌丝体的旺盛生长，减缓菌种的衰退。营养状况包括营养物质的种类和比例。营养物质不足或过丰富都不利于细菌的生长。温度、湿度、空气、光照等环境条件适合细菌正常生长。 (6)预防病毒感染：病毒感染也会引起菌种的降解。对可能感染病毒的菌株应及时淘汰，尤其是病毒含量高、菌丝体、子实体受害严重的菌株。
(2)品系复壮：从衰退种群中寻找尚未衰退的个体，分离培养，恢复品系优良性状的过程称为品系复壮。在实际生产中，菌种复壮一般在菌种退化之前进行。 1. 菌种更新原理：自然界中的生物通过遗传变异的自然选择而进化。变异为选择提供了基础，选择为保存适应了环境的个体，而这些个体让好的性状得以遗传。这样的重新变异、重新选择、重新遗传，如此循环往复，让生物不断进化。
2、菌种复壮法： (1)菌丝尖分离：摘取健壮菌丝的顶端部分，进行提纯培养，使菌种恢复原有活力和优良种，达到复壮的目的。 (2) 适当更换培养基：长期使用同一培养基传代菌株可能会逐渐降低菌株的活力。菌种传代时，应经常更换培养基成分，在培养基中加入酵母膏、维生素等物质，以刺激菌丝生长，提高菌种活力。 (3)分离复壮：从培养的种群中，找出尚未出现衰退迹象的个体，通过组织分离获得菌株，进行纯化复壮。使用菌丝体进行菌种复壮时，先用无菌水稀释斜坡上的菌丝体，然后将菌丝体放入装有无菌蒸馏水的三角瓶中摇匀，然后转移到平板培养基中。使菌丝分布均匀，在适宜的条件下培养，直至萌发成菌落。选择旺盛的菌丝作为母种转移。需要修炼测试。如果复壮菌株与原菌株的性状一致，则表明该菌株已经复壮。 (4)定期分离菌种：对于生产用菌种，生产用菌种必须每隔12年分离一次，才能起到返老还童的作用。通常选择具有该品种典型性状、生长旺盛、无病虫害的子实体进行组织分离，重新获得生长旺盛、生命力强的菌丝体。反复的无性繁殖也会导致物种衰退。定期采集有性孢子，通过单孢子杂交或多孢子杂交对菌株进行复壮。无论采用哪种方法，得到的菌种都必须经过出菇试验证明其性状优良后才能用于生产。 （来源：巴巴街）
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