畸形蘑菇的表现形式多种多样。生产中常见的有：‘雷霆菇’、‘空心菇’、‘大屁股菇’、‘硬开早开伞’、‘红根’、‘水锈斑’等。
‘雷霆蘑菇’。形成的主要原因是覆盖材料太粗、土壤坚硬、覆盖土较厚、覆盖土表层含水量较少。下部及基材的温湿度条件适合子实体的发生和生长，因此在材料表面或覆土上容易形成。中、下层分化形成子实体，然后钻出土表。解决办法：选择优质腐殖土，最好是泥炭土。即使你从普通耕地取土，挖出不到20厘米的生土也没关系。可以将一定量的腐熟牛粪、麦麸、稻壳按比例混合。等待。在收集、干燥和加工土壤的过程中，应将其过筛，使大部分土壤颗粒保持与麦粒相同的大小。最大的可达玉米粒的1/2左右，并伴有一些土粒。覆土不需要太厚，一般3厘米左右就足够了。有条件的话，可先覆盖一层厚度为11.5厘米的粗土，然后再覆盖细土，并注意保持相应的、均匀的含水量。
“空心蘑菇”。这是由于覆盖土层含水量不足或基料含水量低，使菇体无法满足其正常生长所需的水分而引起的。除了解决覆盖土层含水量问题外，适当的棚墒是有效的辅助手段。一般可在85%~90%范围内调整。太高或太低都是不利的。
“大屁股蘑菇”。原因是温室内温度忽高忽低，温差大，或受到冷、热空气侵袭，造成菌盖、菌柄生长不平衡。或者由于棚内湿度过低，覆盖土层含水量适宜等原因，都可能出现大屁股菇。此外，某些化学物质也会导致此类畸形蘑菇的发生。
“伞很难打开”。原因是菇房昼夜温差超过10，或受冷空气侵袭，伞难以打开。出菇密度过高、温度过高、湿度过低、子实体生长过快以及茎细盖薄等都会造成“早开伞”。预防方法是气温升高时，在室外用窗帘遮挡，保持室内温度、湿度基本稳定。
‘红根’。出菇前高温阶段用水过多、土层含水量过多、培养料呈酸性、追施糖分过多、通风不良等都可能引起红根。应注意保持覆土含水量在22%~25%之间，高温时避免喷水。追肥要适量，糖量要适当。若发现红根，适当喷洒一些石灰水。
“水锈斑”。蘑菇喷水数次后，需打开门窗通风0.5至1小时，保持室内空气新鲜。否则，如果菇房湿度过高，蘑菇表面会残留小水滴，时间一长就会形成锈色斑点。
此外，某些药物、油类和气体，如农村常用的柴油、食用菌常用的敌敌畏、取暖炉产生的碳氧化物和二氧化碳等，也会引起其他几种畸形蘑菇的发生，导致蘑菇畸形。应根据具体情况确定。认真分析原因，对症下药，避免对生产造成损害。
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